Zotero

Zotero est un logiciel de gestion de bibliographie.

Avoir des informations de bibliographie complètes et rigoureuses est nécéssaire dans des documents universitaires (thèse, mémoire, article). Cela peut être très important pour des posts de blog ou de site internet, des vidéos, des scripts, et bien d’autres encore. Cela peut aussi être très utile pour gérer ses ressources personnelles, comme nous le verrons plus tard. On appelle les informations de bibliographie d’un document des ‘méta-données,’ à savoir des données a propos du document, mais en dehors du document (son titre, sa date de publication, son/ses auteurs.es, etc.).

Fonctionnalités de Zotero

Zotero permet de :

  • Facilement sauvegarder toutes les métadonnées associés à un document (titre, auteurs, endroit de publication, date, URL, etc.).
  • Associer des notes ou des étiquettes à chaque références.
  • Trier ces références par catégories, ou par leurs caractéristiques pour les retrouver facilement.
  • Télécharger les fichiers PDF associés quand cela est possible.
  • Exporter des fichiers de bibliographie qui contiennent tous les détails de références, pour pouvoir les insérer dans un document.
  • Insérer et gérer la bibliographie d’un document dans Microsoft Word, Libreoffice ou Google Doc a l’aide ses plugins.

Installation de Zotero

  • Rendez vous sur le site de Zotero et téléchargez l’installateur.
  • Suivez les instruction pour l’installer.
  • Si Zotero vous propose d’installer le module pour Word ou Libreoffice, vous pouvez le faire maintenant; sinon, cela vous sera proposé comme exercice.
  • Ouvrez Zotero. Dans sa fenêtre, allez dans l’onglet Outils, et cliquez sur l’option Installer le Connecteur Zotero dans le navigateur. Suivez les instructions pour installer le connecteur.

Prise en main de Zotero

L’interface principale

Dans son interface principale, Zotero vous propose sur la gauche un menu dans lequel vous pouvez créer différentes “collections” qui contiennent des références.

  • Au milieu, vous trouverez la liste des références de la collection dans laquelle vous vous trouvez.

  • A droite, vous trouvez les détails d’une référence sur laquelle vous avez cliqué.

  • En haut, vous trouverez différentes options pour créer une référence vous même. Cependant, vous pourrez le faire automatiquement grâce à l’extension qui connectera Zotero à votre navigateur web.

Le Connecteur de Zotero pour votre navigateur web

Lorsque vous allez sur une page web, que vous lisez un article de blog ou un article scientifique dans votre navigateur internet, le connecteur Zotero vous permet de sauvegarder les informations de la page que vous lisez dans votre bibliothèque de références en un seul clic.

Pour cela, il vous suffit de cliquer sur le bouton du connecteur dans votre navigateur internet, normalement situé en haut à droite. Celui-ci peut prendre différentes icônes, selon la page sur laquelle vous vous trouvez. Zotero détectera automatiquement le document auquel la page fait référence, que ce soit un post sur un blog, un livre, ou un article scientifique.

Exercices

1. Créer une collection

  • En haut à gauche de la fenêtre de Zotero, trouvez le bouton “créer une nouvelle collection.” Utilisez le pour créer une nouvelle collection d’articles nommée “Exercice.”

2. Récuperer 5 références différentes

  • Dans la fenêtre de Zotero, assurez vous que vous êtes bien dans la collection d’articles nommée “Exercice.”
  • Aller sur les liens suivant dans votre navigateur internet : Lien 1, lien 2, lien 3, lien 4, lien 5.
  • Pour chacun des liens, utilisez le bouton du connecteur Zotero dans votre navigateur internet pour que Zotero sauvegarde directement les méta-données liées aux 5 articles dans votre bibliothèque.
  • Regardez les articles dans la fenêtre Zotero : Zotero n’as pas pu trouver toutes les méta-données pour deux d’entre eux. Nous allons aller les chercher nous même à l’aide de Google Scholar.
  • Aller sur Google Scholar. Dans la barre de recherche, tapez le titre d’un des deux articles que Zotero n’as pas réussi à correctement détecter.
  • Dans la liste des résultats de Google Scholar, trouvez l’article. Toujours dans cette liste, trouvez le bouton en formes de guillemets sous les informations de l’article. Dans la pop-up qui s’ouvre, cliquez sur le lien avec écrit “BibTex.”
  • Google Scholar vous amène sur une page ou se trouve un séquence de texte. Il s’agit des informations liées à cette référence au format appelé “BibTex.” Sélectionnez le texte et faite copier ou Ctrl + C.
  • Retournez dans la fenêtre Zotero, allez dans l’onglet Fichier, puis cliquez sur Importer depuis le presse-papier.
  • Vous voyez maintenant que Zotero à inséré les bonnes méta-données de cet article. Supprimez les méta-données incomplètes en faisant un clic droit, puis Mettre le document à la corbeille.
  • Recommencez l’opération pour l’autre article que Zotero n’as pas bien réussi à détecter.

3. Installer le module Zotero pour Word ou pour Libreoffice

  • Si vous ne l’avez pas fait lors de l’installation, installez le module Zotero pour Microsoft Word ou pour Libreoffice, en cliquant sur Edition, Préférences, onglet Citer, onglet Traitement de texte, Installer le module word ou Installer le module Libreoffice.

4. Installer le plugin de Zotero “Better BibTex”

  • Faite un clic droit sur ce lien la et sléctionner “Enregistrer la cible du lien sous…” pour télécharger le plugin “Better BibTex”

💡 Le plugin “Better BibTex” permet de mieux connecter Zotero à l’utilisation de logiciels qui utilisent du Markdown. Nous allons l’utiliser juste après !

  • Dans la fenêtre de Zotero, allez dans l’onglet Outils, puis Extensions. Cliquez ensuite sur la petite icône d’engrenage à droite de la fenêtre, puis choisissez l’option “Installer depuis un fichier.” Dans la fenêtre qui s’ouvre, sélectionnez le fichier du plugin “Better BibTex” que vous avez téléchargé.
  • Redémarrez Zotero.

5. Exporter votre base de donnée de Zotero avec l’option de mise à jour

  • Dans la fenêtre de Zotero, allez dans Fichier, et sélectionnez l’option Exporter la bibliothèque.
  • Dans la liste Format, choisissez le format Better BibTex
  • Dans les options, choisissez l’optionGarder à jour, et laissez toutes les autres décochées.
  • Exportez le fichier .bib résultant quelque part sur votre ordinateur.

💡 Ce fichier .bib contient les informations de toutes les références de votre bibliothèque, associée à un petit code pour chaque que nous allons pouvoir insérer dans des documents en Markdown. En plus de cela, il est gardé automatiquement à jour grace à plugin “Better BibTex”; cela veut dire que chaque fois que vous ajouterez une référence dans Zotero, ce fichier .bib sera mis à jour pour qu’elle y soit ajoutée.

6. Utiliser le plugin BibTex de Joplin pour ajouter des références

  • Ouvrez Joplin.
  • Allez dans l’onglet Outils, puis cliquez sur Options.
  • Allez dans l’onglet Plugins du menu des options.
  • Dans la barre de recherche, cherchez le plugin BibTex et installez le.
  • Redémarrez Joplin.
  • Retournez dans l’onglet Outils, puis cliquez sur Options.
  • Allez dans l’onglet BibTex Plugin qui est apparu dans les options.
  • Dans le champ BibTex File, écrivez le chemin jusqu’au fichier .bib que vous avez généré a l’exercice 5.
  • Choisissez l’option Pandoc syntax (à venir).
  • Quittez les options, et créez une nouvelle note nommée “Note avec références” dans Joplin.
  • Dans cette note, écrivez la phrase suivante :
Les logiciels open-source ont une longue histoire .
  • Positionnez votre curseur dans l’éditeur de Joplin juste avant le point final de la phrase. Puis, vous avez le choix :
    • Dans Joplin, dans la petite barre contenant les boutons de l’éditeur, cliquez sur le bouton en forme de chapeau de diplômé.e. C’est le bouton du plugin BibTex. Dans la liste qui s’ouvre (qui contient vos références), cherchez l’article par Bretthauer que vous avez ajouté auparavant. Appuyez sur “Entrer” pour valider.
    • Écrivez le code de la référence vous même, en écrivant des parenthèses carrées [ ] avec, a l’intérieur, un @ collé a l’identifiant unique de l’article dans Zotero (qui se trouve tout en haut des informations d’un article).
  • Une fois la référence ajoutée, observez son rendu dans l’éditeur.

💡 Vous pouvez observer que le plugin BibTex met en forme la référence a l’intérieur du texte, mais ajoute aussi automatique une partie “références” à la fin de votre note qui indique toutes les documents référencés dans votre note.

💡 La syntaxe que je vous recommande d’utiliser dans vos notes en markdown pour les références est celle utilisée par Pandoc, un logiciel open-source très connu qui permet de transformer un document texte en presque n’importe quel format. Cette syntaxe élégante vous permet de mettre la citation dans le texte dans le format que vous souhaitez. Pour en savoir plus sur cette syntaxe, rendez vous sur ce lien.